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Si usted es un investigador y necesita identificar una pequeña molécula o un compuesto que interactúe con su proteína, por favor contáctenos.

GRID-infraestructura computacional

Docking (acoplamiento) es una técnica de cálculo utilizada para predecir la interacción de un ligando a un receptor (ver video más abajo). La técnica es ampliamente utilizada en estudios de alto rendimiento teniendo en cuenta su tiempo de ejecución relativamente corto en comparación con otras técnicas. Por lo tanto, docking se utiliza ampliamente para chequear miles de compuestos para la identificación de posibles nuevas moléculas con efectos terapéuticos. Sin embargo, estos estudios de alto rendimiento requieren una gran potencia de cálculo considerando la cantidad de compuestos a acoplar.


Hemos implementado en nuestro laboratorio una infraestructura BOINC que nos permite compartir tareas de cómputo de nuestro programa de acoplamiento FlexAID entre todas las computadoras conectadas a nuestro servidor. El software es ahora compatible con el sistema operativo Windows, lo cual permite la participación de una gran cantidad de usuarios en todo el mundo:

Estamos ahora en condiciones de acoplar hasta 2.500 compuestos por hora:

Aun requerimos la ayuda de más voluntarios para compartir tiempo computacional a fin de acelerar la investigación en diferentes proyectos relacionados con la salud. De hecho, el propósito de los proyectos es la caracterización de nuevos inhibidores para:
La proteasa Matriptasa, implicada en la progresión del desarrollo del cáncer
La proteasa Matriptasa-2, importantes para la regulación de la homeóstasis del hierro
Las GPCRs, asociadas a la diabetes
Las quinasas responsables del cáncer de mama triple negativo
La proteasa de germinación de Clostridium difficile

Estamos muy agradecidos con la gente que aporta tiempo de cómputo para nuestros proyectos de investigación con relevancia médica. Su apoyo está ayudando enormemente a acelerar el descubrimiento de nuevas vías terapéuticas. La ayuda de todos y cada uno de ustedes es muy importante. Les informamos que el uso de la plataforma BOINC no compromete su información personal o hardware y que pueden darse de baja en cualquier momento.

Si quieres contribuir a este proyecto, necesitas:

  1. descargar el cliente BOINC disponible para tu plataforma, en el siguiente enlace:
  2. unirte a nuestro proyecto cliqueando en Tools (herramientas) -> Add a project (agregar un proyecto) y escribiendo la siguiente URL:
    http://boinc.med.usherbrooke.ca/nrg

  3. ajustar tus preferencias en el Preference menu (menú de preferencias)

    Una vez conectado, el cliente BOINC se iniciará automáticamente cuando se reinicie la computadora. Por default, las tareas de cálculo sólo se ejecutan cuando la computadora está inactiva (los cálculos no se ejecutarán si está en modo de reposo). Las tareas de cálculo sólo requieren un solo core de la CPU. En consecuencia, si tu CPU tiene varios cores, se podrán ejecutar varias tareas simultáneamente. Los créditos acumulados por completar con éxito una tarea no son canjeables.


Si tienes alguna pregunta relacionada con este tema, no dudes en contactarnos.