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The IsoCleft Finder Interface allows you to identify binding site atomic similarities between a query protein and a database of proteins.

Use the form below to run an analysis on a query PDB file.


 Si vous avez des questions concernant IsoCleftFinder, veuillez contacter Natalja Kurbatova natalja@ebi.ac.uk ou Rafael Najmanovich rafael.najmanovich@usherbrooke.ca

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Select a query PDB

Enter a PDB code:

Or upload one:

Define the cavity (optional)

Define the cavity around a specific ATOM or HETATM:
Residue Name (eg.: NDP):
Residue Number (eg.: 2001):
Chain (eg.: A):

Compare against which dataset

Dataset:

Parameters


Geometric Distance Threshold:

Minimum cognate similarity of hits:

Show only different PFAM families:

The number of top results:

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